Apollonia rakennettiin 588 eKr.. jo illyrialaisten asuttamille kukkuloille muinaisen Dyrrachiumin perustamisen jälkeen. Sen perusti joukko kreikkalaisia siirtolaisia Korfun ja Korintin alueelta Gylaxin johdolla. Nuori Augustus, joka ei ollut vielä keisari mutta jota Caesar jo suojeli, tuli opiskelemaan Apolloniaan. Täällä kulki kauppiaita ja kirjeenvaihtajia, komentajia ja uskovaisia. Kaupungin julkiset rakennukset kehittyivät kahden kukkulan keskelle, sotilaskoulutukseen tarkoitetun alueen (Arx) ja jumalanpalvelukseen tarkoitetun alueen (Temenos) väliin. Temenoksessa on Apollon temppeli ja joidenkin 6. vuosisadalta eKr. peräisin olevien muistomerkkien jäännökset sekä dorilainen temppeli, varastoja ja kaksi pientä pyhäkköä. Apollonian elämän keskus oli agora, jossa oli useita rakennuksia. Kreikkalainen teatteri ja nymfeille omistettu muistomerkki, joitakin poliittisia rakennuksia, kuten Bouleterion, Odeon, kirjasto, Riemukaari, Dianan temppeli ja Prytaneion, silloinen pieni paikallinen parlamentti.