Paras aika matkustaa Gilgitiin on keväällä (huhtikuusta toukokuuhun) ja syksyllä (syyskuusta lokakuuhun). Nämä ajat tarjoavat miellyttävimmät sääolosuhteet alueen tutkimiseen.Keväällä Gilgitissä lämpötilat vaihtelevat 15 °C:sta 25 °C:een. Laaksot ovat reheviä ja vihreitä, ja hedelmäpuut kukkivat, mikä tekee ajeluista ja kävelyistä erittäin maisemallisia. Tämä on erinomainen aika niille, jotka nauttivat ulkoilusta, kuten kevyestä vaelluksesta ja valokuvauksesta, sillä kirkas taivas tarjoaa upeat näkymät ympäröiville vuorille ilman kesän voimakasta kuumuutta.Syksy, syyskuusta lokakuuhun, tuo mukanaan viileämpiä lämpötiloja, jotka ovat 10 °C:n ja 20 °C:n välillä. Maisema muuttuu eloisilla syksyn väreillä, erityisesti poppeli- ja aprikoosipuut luovat silmiinpistävän kontrastin karujen vuorten taustalle. Tämä vuodenaika on ihanteellinen pariskunnille, jotka etsivät rauhallista pakopaikkaa, ja niille, jotka ovat kiinnostuneita kulttuurikokemuksista, sillä paikallisia festivaaleja järjestetään joskus tähän aikaan. Sää on yleensä vakaa, mikä sopii hyvin mukavaan nähtävyyksien katseluun.Vaikka kesä (kesäkuusta elokuuhun) on myös suosittu, ja lämpötilat voivat nousta yli 30 °C:een, se voi olla joillekin matkailijoille melko lämmin. Talvi (marraskuusta maaliskuuhun) on erittäin kylmä, ja runsas lumisade sulkee usein vuoristosolat, mikä tekee matkustamisesta haastavampaa.
