Yli 120 hehtaarille levittäytyvä San Juanin kasvitieteellinen puutarha on suuri kaupunkipuutarha, joka pyrkii suojelemaan ja tutkimaan paikallisia ja eksoottisia kukkia, kasveja ja puita. Puutarhaa ylläpitää San Juanin yliopisto ja se toimii sekä tutkimuslaitoksena että kaupunkilaisten virkistysalueella. Noin 30 hehtaaria puutarhasta on avoinna yleisölle ja sisältää useita pysyviä näyttelyitä.
On helppo ymmärtää, miksi sekä turistit että paikalliset vierailevat mielellään kasvitieteellisessä puutarhassa. Nauti piknikistä puutarhan laajoilla nurmialueilla tai hakeudu palmupuutarhassa kasvavien 125 eri palmulajin varjoon. Useita puutarhoja on omistettu paikallisille kasveille. Helikoniakasveille omistetusta puutarhasta löytyy useita Keski-Amerikan trooppisten alueiden kirkasvärisiä kasveja, kun taas taino-puutarhassa voi tutustua taino-intiaanien käyttämiin kasveihin.
Puutarhassa järjestetään opastettuja kierroksia, joista osa toteutetaan ajoneuvoilla, jotta vieraat näkisivät mahdollisimman paljon puutarhasta. Kierroksilla kerrotaan opettavaista ja tieteellistä tietoa erityisesti kasvien ystäville ja kierrokset sopivatkin paremmin aikuisille kuin lapsille. Perheille paras tapa tutustua kasvitieteelliseen puutarhaan on kulkea runsaita metsäpolkuja pitkin, tutustua joen ympäristöön ja rentoutua juomien parissa puutarhan ravintolassa. Huomaa, että puutarha on hyvin laaja ja varjoisia paikkoja on vain vähän, joten mukaan kannattaa ottaa vesipullo ja auringolta suojaava hattu.
Kasvitieteellinen puutarha sijaitsee San Juanin eteläosassa. Sinne voi ajaa autolla, ja puutarhan ympäristössä on ilmaisia pysäköintipaikkoja. Julkista liikennettä käyttävien vierailijoiden kannattaa jäädä pois Rio Piedrasin asemalla. Puutarha on auki päivittäin juhlapyhiä lukuun ottamatta. Puutarhaan ei ole pääsymaksua.
