Paras aika vierailla Kukësissa on myöhään keväällä (toukokuusta kesäkuun alkuun) ja alkusyksystä (syyskuusta lokakuuhun), jolloin sää on miellyttävin tutkimiseen.
Näinä kuukausina koet leudot lämpötilat, tyypillisesti 15°C - 25°C, vähemmän sadetta kuin keväällä ja vähemmän ihmisiä kuin kesähuippukuukausina. Tämä tekee siitä ihanteellisen ulkoiluun, kuten vaellukseen ympäröivillä vuorilla, Drin-joen tutkimiseen tai yksinkertaisesti kaupungin rentoista tahdista nauttimiseen.
Vaelluksesta ja ulkoiluseikkailuista kiinnostuneille välikaudet tarjoavat mukavat olosuhteet pidemmille vaelluksille ilman heinä- ja elokuun voimakasta hellettä. Luonnonkauneus on myös viehättävimmillään, keväällä rehevän vihreää ja syksyllä eloisia värejä.
Kesä, heinä-elokuussa, voi olla melko kuuma, lämpötilojen ylittäessä usein 30°C. Vaikka se on suosittu aika paikallisille turisteille, helle saattaa olla vähemmän mukava niille, jotka eivät ole tottuneet siihen, erityisesti aktiiviseen nähtävyyksien katseluun.