Paras aika vierailla Marsaxlokkissa on keväällä (huhtikuusta toukokuuhun) tai syksyllä (syyskuusta lokakuuhun), jolloin sää on miellyttävä ja mukava tutustua kohteeseen.
Näinä kuukausina päivät ovat lämpimiä ja aurinkoisia, täydellisiä kävelyyn satamaa pitkin, ulkona ruokailuun ja kuuluisilla sunnuntaisilla kalamarkkinoilla vierailuun. Lämpötilat ovat leutoja, tyypillisesti 20-25°C, mikä tekee siitä ihanteellisen nähtävyyksien katseluun ilman kesän voimakasta hellettä. Koet myös vähemmän väkijoukkoja verrattuna kesäsesonkiin, mikä mahdollistaa rennomman ja aidomman kokemuksen kylästä.
Kesä (kesäkuusta elokuuhun) on myös suosittu vierailuaika, erityisesti niille, jotka nauttivat lämpimämmästä säästä ja uimisesta. Lämpötilat voivat nousta 30°C:een tai korkeammalle, ja kylä voi olla melko vilkas, erityisesti markkinapäivinä. Vaikka on kuuma, merituuli tarjoaa usein helpotusta, ja se on loistavaa aikaa veneretkille ja läheisistä lahdista nauttimiseen.
Talvi (marraskuusta maaliskuuhun) tuo mukanaan viileämmät lämpötilat, yleensä 10-15°C, ja suuremman sateen mahdollisuuden. Vaikka sää on edelleen miellyttävä tutustumiseen, jotkut ulkoaktiviteetit voivat olla rajoitettuja, ja markkinat voivat olla vähemmän vilkkaat.
