Paras aika matkustaa Poconéen on kuivana kautena, joka kestää toukokuusta syyskuuhun.Näinä kuukausina sää on ennustettavampi, sateet vähäisempiä ja ilmankosteus matalampi, mikä tekee siitä ihanteellisen villieläinten tarkkailuun ja ulkoiluun. Pantanal, ollessaan tulva-aluetta, on paljon helpompi liikkua, kun vedenpinnat laskevat, ja eläimet keskittyvät jäljellä olevien vesilähteiden ympärille.Niille, jotka haluavat nähdä suuren määrän villieläimiä, erityisesti jaguaareja, myöhäinen kuiva kausi (elokuu ja syyskuu) on usein suositeltavaa. Transpantaneira-valtatie, Pantanalin läpi kulkeva pääväylä, on myös parhaassa kunnossa tänä aikana.Märkäkausi, lokakuusta huhtikuuhun, tuo mukanaan rankkoja sateita ja korkean ilmankosteuden, mikä voi tehdä matkustamisesta haastavaa ja heikentää villieläinten näkyvyyttä laajentuneen vesipeitteen vuoksi.