Paras aika vierailla Margaritassa on keväällä (huhtikuusta kesäkuun alkuun) ja syksyllä (syyskuusta lokakuuhun), jolloin sää on miellyttävä ja väkijoukot ovat pienempiä.Kevät tarjoaa leudot lämpötilat, mikä tekee siitä ihanteellisen saaren luonnonkauneuden, kuten Olympoksen vuoren vaellusreittien tai arkeologisten kohteiden tutkimiseen ilman voimakasta kesähellettä. Maaseutu on rehevää ja vihreää, ja luonnonkukat kukkivat. Se on myös loistavaa aikaa pariskunnille nauttia rauhallisesta lomasta ennen päämatkailukauden alkua, ehkä rentoutuen vähemmän ruuhkaisella rannalla tai tutustuen viehättäviin kyliin.Syksy tarjoaa myös miellyttävät lämpötilat, jotka sopivat erinomaisesti ulkoiluun, kuten pyöräilyyn tai paikallisten viinitarhojen ja oliivilehtojen vierailuun. Meri pysyy riittävän lämpimänä uimiseen lokakuun loppuun asti. Tämä ajanjakso on erityisen hyvä niille, jotka etsivät rennompaa tahtia, sillä kesäruuhka on laantunut, mutta useimmat palvelut ovat edelleen avoinna. Perheet saattavat pitää tätä aikaa houkuttelevana rauhallisempaan lomaan, jossa rannoilla ja nähtävyyksillä on runsaasti tilaa.Vaikka kesäkuukaudet (heinä- ja elokuu) ovat suosittuja, ne tuovat mukanaan korkeammat lämpötilat ja suuremmat väkijoukot, erityisesti suurimmissa lomakohteissa ja rannoilla.