Parhaita kylpylähotelleja Shillongissa ovat Courtyard By Marriott Shillong, Vivanta Meghalaya, Shillong ja Polo Cherrapunjee Resort.Viiden tähden Courtyard By Marriott Shillong, jonka luokitus on 9,6, tarjoaa poikkeuksellisen kylpyläkokemuksen laajalla valikoimalla hoitoja, mukaan lukien kasvohoitoja, vartalokuorintoja, vartalokääreitä ja syväkudoshierontoja. Ne tarjoavat myös pariskunnille tarkoitettuja hoitohuoneita ja ayurveda-hoitoja.Toinen erinomainen valinta on viiden tähden Vivanta Meghalaya, Shillong, jonka luokitus on 8,8. Tässä hotellissa on täyden palvelun kylpylä saunalla ja höyrysaunalla, jotka tarjoavat hyvinvointikokemuksia.Kolmen tähden Polo Cherrapunjee Resort, jonka luokitus on 8,8, tarjoaa myös täyden palvelun kylpylän hierontahoidoilla ja erillisillä hoitohuoneilla, jotka ovat saatavilla päivittäin vieraille.